El sector Residuos, que incluye las emisiones de GEI resultantes de procesos microbiológicos que ocurren en la materia orgánica de residuos sólidos bajo degradación anaeróbica, el tratamiento biológico de los residuos, la incineración y el tratamiento anaeróbico de aguas residuales domésticas e industriales; representó un 5 % del balance de GEI en 2020. En el mismo año, sus emisiones alcanzaron las 7.660 kt CO₂ eq, incrementándose en un 383 % desde 1990 y en un 4 % desde 2018, debido al aumento de la población,los residuos generados tanto líquidos como sólidos,y los cambios en los sistemas de tratamiento de los residuos (Figura 25).

A continuación, se describen a grandes rasgos solo dos de las categorías más importantes para este sector, que corresponden a Disposición de residuos sólidos (5.A.) y Tratamiento y descarga de aguas residuales (5.D.).